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新疆農業職業技術大學開設的專業有：。
省級(直轄市)級特色專業：3個：計算機網絡技術、農產品加工與質量檢測、化工生物技術。
省重點、培育專業級特色專業：1個：農業裝備應用技術。
新疆農業職業技術學院坐落于絲綢之路經濟帶核心區，素有“西域咽喉”美譽之稱的昌吉市，是一所舉辦高等職業教育的公辦全日制普通高等學校。學院前身是創建于1958年的昌吉農業學校，1988年隸屬自治區農業廳改名為新疆農業學校，2000年升格為新疆農業職業技術學院，2008年與原自治區農業干部學校合并，整合為現今的新疆農業職業技術學院。2022年2月，自治區農業農村廳黨組整合廳屬科教資源，將廳屬科研單位與學院一體化整合，實現產科教資源共享、優勢互補，快速提升自治區“三農”人才培養質量和鄉村振興、農業農村現代化科技服務支撐能力，開創了全國職業院校與科研院所融合發展的先河。
學院牽頭組建新疆第一產業職教園區，積極參與中國現代農業等5個全國農業職教集團及全國職業院校鞏固扶貧成果服務鄉村振興協作聯盟，牽頭昌吉州現代農業職教集團建設，構建形成“國家-自治區-地州”三級職教集團化辦學格局，在全疆構建“四中心、八基地”新技術示范服務與培訓網絡體系。學院服務新時代黨的治疆方略，先后整體托管喀什地區莎車縣、疏附縣、和田地區洛浦縣4所中等職業學校，開創了托管幫扶新模式。與和田洛浦中等職業技術學校、兵團興新職業技術學院聯合成立“鄉村振興人才培養學校”。學院年培訓農牧民3.6 萬人次以上，累計推廣棉花、水稻、玉米等優良品種及優質高效栽培模式近百萬畝，帶動 10 余萬戶農民脫貧致富。
