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皖南醫學院開設的專業有：制藥工程、藥物制劑、藥學、中藥學、臨床藥學、口腔醫學、公共事業管理（衛生事業管理方向）、應用心理學、法學、保險學、麻醉學、食品衛生與營養學、預防醫學、護理學、助產學、信息管理與信息系統、醫學信息工程、智能醫學工程、臨床醫學、康復治療學、法醫學、醫學影像技術、醫學影像學、生物醫學工程、衛生檢驗與檢疫、醫學檢驗技術。
國家級級特色專業：1個：法醫學。
省級(直轄市)級特色專業：9個：法學、護理學、醫學檢驗技術、醫學影像學、臨床醫學、口腔醫學、法醫學、預防醫學、麻醉學。
皖南醫學院地處素有“長江巨埠、皖之中堅”之稱的歷史名城——蕪湖市，瀕臨浩瀚長江，匯集江南神秀。學校建于1958年，時為蕪湖醫學專科學校；1971年并入安徽醫學院，為安徽醫學院皖南分院；1974年經國務院批準獨立建校，命名為皖南醫學院；1981年學校獲得國務院學位委員會學士學位和碩士學位授予權；1998年一次性通過教育部本科教學工作合格評價；2008年順利通過教育部本科教學工作水平評估并獲優秀等級；2018年順利通過教育部本科教學工作審核評估。2019年，學校成為安徽省博士學位授權立項建設單位。2020年通過臨床醫學專業認證，有效期六年。
學校注重教學科研團隊和平臺建設，現有國家級虛擬仿真實驗教學項目1 個、省級虛擬仿真實驗教學項目15個、省級人才培養模式創新實驗區1 個、省級教學團隊16個、課程思政教學團隊2個，省級卓越人才教育培養計劃7 項、省級“六卓越、一拔尖”卓越人才培養創新項目6個、省級精品類課程41 門、省級一流課程25門，省級智慧課堂（含試點項目）12門、省級示范實驗實訓中心7個；有10個省級科研平臺：安徽省多糖藥物工程技術研究中心、活性生物大分子研究安徽省重點實驗室、大學生心理健康教育研究中心安徽省人文社科重點研究基地、重大疾病非編碼RNA轉化研究安徽省普通高校重點實驗室、安徽省皖南地區植物藥活性篩選與再評價工程實驗室、老年疾病國家臨床醫學研究中心安徽分中心、安徽省危重癥（呼吸疾病）臨床醫學研究中心、中藥藥理三級實驗室、安徽省藥物臨床評價中心、國家藥物臨床試驗機構。公開出版《皖南醫學院學報》《中國臨床藥理學與治療學》2種學術期刊。圖書館館藏紙質圖書98.6萬冊、電子圖書430萬冊、中外文報刊1116種。
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