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上海海關學院開設的專業有：國際商務、審計學、物流管理、英語、稅收學、經濟統計學、法學、行政管理、海關管理。
上海海關學院是海關總署唯一直屬的全日制本科高等學校。前身為創建于1953年的上海海關學校；1980年5月，經國務院批準，升格為上海海關專科學校；1996年4月，原國家教委批準更名為上海海關高等?？茖W校；2007年3月，經教育部批準，設立上海海關學院，成為新設置的全日制普通高等學校。2018年5月，學校獲批成為碩士學位授予單位，同時獲批公共管理以及稅務2個碩士專業學位授權點，辦學層次實現跨越，同年海關管理專業成為世界海關組織PICARD標準認證專業。2019年，學校獲批1個國家級一流本科專業建設點和1個省級一流本科專業建設點。2021年，學校設立上海海關學院臨港國際校區，同時獲批國際商務、翻譯碩士2個專業學位授權點，順利納入上海市博士授予單位培育建設名單以及上海市博士后流動站建設籌備單位名單。
學校位于上海市浦東新區，占地面積521畝。下設蘇州分校，位于蘇州市吳中區，占地133畝。按照教育部普通高等學校設置標準，學校建有現代化的教學樓、圖書館和先進的ATM校園網，教室都具備多媒體授課的條件；并建有數碼閱覽室、視聽室、文娛活動綜合樓、網球場、游泳館、體育館等配套設施，為學生營造一個良好的學習和生活環境。
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