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安徽中醫藥大學開設的專業有：康復治療學、針灸推拿學、數據科學與大數據技術、生物醫學工程、信息管理與信息系統、醫學信息工程、計算機科學與技術、食品質量與安全、藥學、中藥學、中藥資源與開發、制藥工程、生物制藥、藥物分析、藥物制劑、中西醫臨床醫學、中醫兒科學、中醫學、護理學、漢語國際教育、應用心理學、國際經濟與貿易、公共事業管理、人力資源管理、保險學。
國家級級特色專業：5個：中醫學、針灸推拿學、中西醫臨床醫學、中藥學、藥學。
省級(直轄市)級特色專業：6個：公共事業管理、應用心理學、中西醫臨床醫學、康復治療學、制藥工程、藥物制劑。
安徽中醫藥大學創建于1959年，其前身為1952年創立的安徽省中醫進修班。1959年，安徽省政府正式批準成立安徽中醫學院。1970年，安徽中醫學院并入安徽醫學院。1975年，國家教育部批準恢復安徽中醫學院。2000年，安徽省醫藥學校并入安徽中醫學院。2011年，省政府批準在安徽中醫學院的基礎上組建成立安徽省中醫藥科學院。2013年，教育部同意安徽中醫學院更名為安徽中醫藥大學。學校是“中西部高校基礎能力建設工程”項目高校，是安徽省“地方特色高水平”大學建設高校。
學校是國家中醫臨床研究基地、國家中藥現代化科技產業（安徽）基地、國家中醫藥國際合作基地、國家藥品臨床研究基地，國家博士授權單位、碩士研究生推薦免試單位。現占地總面積1269.68畝，有少荃湖、梅山路、史河路、六安路四個校區。圖書館藏書207.16萬冊，古籍部珍藏古籍線裝書3.3萬冊，是“全國古籍重點保護單位”。中藥資源中心臘葉標本室儲藏了15萬余份藥用植物臘葉標本，是全國醫藥院校珍藏標本最豐富的標本室。新安醫學文化中心是安徽省中醫藥文化宣傳教育基地。
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