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福建衛生職業技術學院開設的專業有：針灸推拿、中醫康復技術、口腔醫學、中醫學、康復治療技術、臨床醫學、智能醫療裝備技術、醫學檢驗技術、醫學影像技術、眼視光技術、藥品生產技術、保健食品質量與管理、藥學、藥品經營與管理、中藥學、預防醫學、醫學營養、衛生信息管理、健康管理、醫學美容技術、體育保健與康復、護理、老年保健與管理、助產、嬰幼兒托育服務與管理。
福建衛生職業技術學院是一所經福建省人民政府批準設置、教育部備案的公辦全日制普通高等學校，是福建省示范性現代高等職業院校，主要培養護理、藥學、醫學技術、臨床醫學、衛生管理類技術技能型醫藥衛生人才。學校的前身是創辦于1912年的福州馬高愛醫院附設看護學校，是中國首批注冊的護士學校之一，2005年由福建衛生學校和福州衛生學校合并組建。學校1954年開辦藥學和醫學檢驗專業，是福建省最早的藥學和醫學檢驗人才培養基地；1986年在全省醫藥衛生院校中率先開設醫學影像專業；是全國首批開設預防醫學專業的4所高職院校之一。2021年6月，成功入選福建省高水平職業院校和專業計劃（A類）立項建設單位。
學校現有全日制高職在校生11324人，專業26個，覆蓋醫學及醫藥相關專業，形成了醫、藥、護、技、管5個專業群，畢業生就業率穩定在99%以上。與5所中職學校開展7個專業聯合辦學，與福建醫科大學開展臨床醫學（全科醫學方向）、醫學檢驗技術、醫學影像技術等3個專業高職本科貫通人才培養項目，構建起“中職—高職—應用本科”縱向融通的現代職業教育體系。護理、藥學、臨床醫學、醫學檢驗技術等4個專業列入全國高等職業教育創新發展行動計劃骨干專業；藥學、醫學檢驗技術等2個專業群入選省級高水平專業群建設項目；護理、藥學、醫學檢驗技術、醫學影像技術、助產、中藥等6個專業列入省高等職業教育示范專業；母嬰與老年健康照護、臨床醫學、藥學和醫學技術等4個專業群獲批省級服務產業特色專業群；醫學美容技術、口腔醫學、助產和醫學檢驗技術等4個專業列入省級創新創業教育改革試點專業；護理、眼視光技術等2個專業列入省級產教融合示范專業；藥學專業獲批全國首批健康服務類示范專業點；眼視光技術、中藥、康復治療技術、醫學影像技術（放射治療技術方向）等4個專業獲批福建省教育廳現代學徒制試點項目；藥學、中藥、護理、康復治療技術、醫學影像技術、醫學檢驗技術等6個專業獲批福建省教育廳“二元制”技術技能型人才培養改革試點項目。獲批老年照護等13個“1+X”職業技能等級證書制度試點項目，中藥炮制工等10個職業技能等級認定工種。
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